本申请提供一种船用隔离舱通风系统，包括送风围阱、送风机、多个甲板通风通道、排风围阱和排风机。送风围阱包括有进风口、送风通道和多个送风口，进风口与隔离舱外部连通。送风机布置在进风口处并位于隔离舱的外部，用于将隔离舱外部的气体送入进风口。多个甲板通风通道的入口与送风围阱的出风口连通。排风围阱包括多个排风口、排风通道和一个出风口，每个甲板通风通道的出口经排风口与排风通道连通。排风机布置在出风口处并位于隔离舱的外部，用于在排风通道内形成负压以将隔离舱内气体排出。在该通风系统设计中，采用顶部送风和底部排风相结合的通风系统，确保整体气流场，利于将易沉积在隔离舱的底部区的油气完全排出隔离舱。