本发明公开了一种有机工质分布式供能系统蒸发器液位平衡控制系统及方法，使蒸发器和冷凝器的液位达到平衡，同时使得泵始终运行在高效区内。一种有机工质分布式供能系统蒸发器液位平衡控制系统，包括工质泵，工质泵的出口端通过管道依次连接工质调节阀、蒸发器、膨胀机、冷凝器、工质泵的进口端，所述蒸发器、冷凝器均设有液位传感器，用于检测蒸发器和冷凝器的实际液位参数，所述冷凝器、工质泵的进口端之间还设有旁通管路，所述旁通管路上设有工质旁通阀，用于通过旁通管路将多余的工质返回到工质泵的进口端，使蒸发器和冷凝器的液位达到平衡，同时使得泵始终运行在高效区内。