本发明公开了一种汽车发动机可变气门升程的控制方法及控制系统，该控制方法包括：获取发动机运行时车辆所处位置的大气温度、大气压力和大气湿度，并根据该大气温度、大气压力和大气湿度判断车辆所处的大气环境；根据车辆所处的大气环境，从预设的VVL控制MAP集中选择对应的VVL控制MAP；获取油门踏板信号、档位信号和对应的发动机转速，确定车辆在该发动机转速下的驾驶员需求扭矩；在对应的VVL控制MAP中，查找与所述发动机转速、所述驾驶员需求扭矩对应的升程，并基于该升程形成VVL控制策略；控制VVL执行器执行所述VVL控制策略；本发明能使得发动机全工况处于最佳工作区，给用户更好的油耗和排放及动力响应体验。