本发明公开了一种多层陶瓷电容器及其制备方法，所述制备方法包括：提供第一层叠单元，包括第一介电层和第一内电极层，第一介电层的第一孔和第二孔处形成有导电体，第一内电极层位于第一介电层的上表面并电性连接第一孔处的导电体；提供第二层叠单元，包括第二介电层和第二内电极层，第二介电层的第三孔和第四孔处形成有导电体，第二内电极层位于第二介电层的上表面并电性连接第四孔处的导电体；提供保护层，保护层的第五孔和第六孔处形成有导电体；使第一层叠单元和第二层叠单元交替层叠设置，保护层覆盖最上层的第一层叠单元或第二层叠单元。上述制备方法得到的多层陶瓷电容器能避免介电层被向下推压的现象，因此具有更佳的性能。