惯性轨道测量仪动态校准系统、方法及其应用，该系统是基于双速度传感器与车载天线阵列组合的惯性轨道测量仪动态校准系统，包括轨道、轨距传感器、惯性传感器、差分基站；车载天线阵列每根地面天线中心位置都具备对应的工程坐标系坐标；并且同一根地面天线至少与两个差分基站的数据进行解算；轨道采用速度传感器进行速度测量,并配合轨距传感器进行航向角偏移测量；将该速度变化和角度变化用于惯性传感器的加速度和角速度校准；所述差分基站通过无线通信链路与所述车载天线阵列实现无线通信。本发明解决了惯性轨道测量仪校准需要静态停留的问题，避免了现有技术在开始测量前必须静态校准的问题，实现惯性轨道测量仪的动态校准。