本发明提供了一种基于双光纤和对撞流的光流控分选微纳颗粒芯片，包括光学分选腔，所述光学分选腔的第一侧通过对撞流道与对撞流入口连接，所述光学分选腔的第二侧布置有至少一个鞘液流入口和样品流入口，所述鞘液流入口、所述样品流入口分别与鞘液流道、样品流道连接，所述鞘液流道与所述样品流道合并后为聚焦流道，所述聚焦流道的中心线与所述对撞流道的中心线在同一直线上，所述聚焦流道与光学分选腔连接，所述光学分选腔的其它侧面还布置有激光发射模组，以及大粒子出口、小粒子出口。本发明结合了光力和微流控技术的优点，通过对光场和流场两个部分进行改进，提高了微纳颗粒的分选效率，保证了分选精度，结构简单，操作简易。