本发明属于无线通信安全技术领域，涉及一种适用于低信噪比环境的物理层密钥生成方法，所述方法包括通信双方在相干时间内互发导频信号并分别进行信道估计；通信双方依据同样的规则对信道频率响应交织；通信双方分别计算己方交织后信道频率响应星座图中连续三点构成夹角的角度并量化成初始密钥；一方对己方初始密钥做信道编码并将校验位和校验矩阵传递给另一方；另一方将接收到的校验位附于己方初始密钥与一方校验位相同的索引位置，并做一样的译码方案得到信息位；采用哈希函数对通信双方经过协商的密钥隐私增强。本发明利用信道频率响应星座图任意三点所成角度做为量化特征值，使密钥不一致率大幅降低。