本发明公开了一种基于故障观测器的直流微电网分散式容错控制方法及控制器，所述控制方法主要包括以下步骤：获取状态信息、计算微分同胚映射的控制误差、计算微分同胚映射的状态估计误差、计算故障观测器、计算控制律、计算电压误差补偿项、计算电压误差与占空比。用于直流微电网在执行器故障的情况下，实现直流母线电压跟踪和电流比例分配的容错控制。与分布式协同控制方法相比，本发明无需占用控制系统的通讯资源，能够完成执行器故障信号的实时估计并修正控制律，有效抵御执行器故障对电压跟踪和电流分配的影响，提升了直流微电网的容错性能与安全裕度。本发明基于李雅普诺夫方法证明了所述控制方法的稳定性，并给出了所需的假设条件和参数条件。