一种铁路站房结构损伤的多重分步识别方法及系统，所述方法包括：步骤1，根据铁路站房结构各部分不同特点将铁路站房结构分为多个子结构；步骤2，确定铁路站房结构中有损伤的子结构，然后在已知有损伤的子结构内确定有损伤的构件，最后确定有损伤构件的损伤程度。本发明首先根据结构各部分不同特点将站房分为多个子结构，并进一步将每个子结构里的构件根据敏感性分析分为重要构件和一般构件，确定站房中有损伤的子结构，然后在已知有损伤的子结构内确定有损伤的构件，最后确定有损伤构件的损伤程度。这一方法可以减少网络的复杂性，大大减少学习样本，从而节约学习时间。