本发明提供一种穿越混卵砾石层和砂岩层的顶管施工方法，在顶管施工的起点和终点分别设置工作井和接收井；在工作井内安设顶进设备并调试；通过顶进设备推进顶管机进入土体后，缩回顶进设备，在顶管机后方安设管节，使顶管机继续向土体推进一定距离后，安放下一管节，使顶管机沿顶管施工路线持续推进；顶管机在混卵砾石层进行推进时，提高触变泥浆注入量，并持续进行补浆，保持开挖面的土仓压力平衡；顶管机在砂岩层进行推进时，通过进行跟踪测量指导顶管机进行顶进纠偏。针对不同地质对顶进方案进行调整，使顶管机在混卵砾石层具有足够的泥浆，以降低顶进阻力，在砂岩层对已顶进的管节进行连续补浆减阻，并通过顶进曲线进行纠偏，避免顶进管道偏移。