本发明公开了一种微波协同消杀流水线设备，涉及食品加工技术领域。本发明包括基板，基板的装设有两个龙门架、上侧转动有第一转辊、第二转辊、第三转辊和第四转辊，两个龙门架之间设有三个高功率脉冲微波杀菌仪，两个横梁之间转动配合有托板，托板的下侧固定有安装板，两个安装板之间转动配合有转杆，转杆的中部设有凸块。本发明通过第二电机带动转杆和凸块转动的作用，方便带动固定板将肉制品转移到处于后侧的传送带上侧，同时能够对肉制品进行翻身的操作，通过弹簧的作用方便在被凸块支撑起来后恢复处时状态，通过高功率脉冲微波杀菌仪的作用，方便对放置在传送带上侧的肉制品进行杀菌消毒。