本发明公开了一种微波消杀装置，涉及微波消杀技术领域。本发明包括消杀通道，消杀通道包括底座、装设在底座上侧的U型盖板，底座上侧装设有操作台、翻转机构、推料机构、两交错托举机构；操作台上开设有与交错托举机构相对应的第一贯穿孔、与翻转机构相对应的开口，推料机构装设在U型盖板侧部内壁上，推料机构一端滑动配合在操作台上侧，操作台与底座之间装设有多个第一支撑柱。本发明通过设置推料机构便于带动冷藏食品在操作台上侧移动，通过设置两交错托举机构，便于对冷藏食品进行二次消杀和杀菌，通过设置翻转机构，便于带动冷藏食品翻转，使冷藏食品周侧消杀和杀菌更加均匀，提高消杀和杀菌效果的合格率和效率。