本发明公开了一种用于热真空试验的多区独立控温方法，包括以下部分：A.控温分区的设置：划分六个控温分区，分别为控温分区一、控温分区二、控温分区三、控温分区四、控温分区五和控温分区六由控制指令单元控制，采用六路独立控温方式，分区中设有移动温度传感器；B.各控温分区均由可编程控制器PLC发出的信号控制；C.控温分区一、控温分区二、控温分区三、控温分区六，采取制冷量调节和加热量调节两种方法进行精确控制。本发明中，涉及多种换热方式，可实现异步独立多分区控温，既能满足不同航天器部组件在热真空试验过程中对于温度的不同要求，又能够提高控温精度和温度均匀性。