一种交通工具座舱负压隔离系统，包括高压气幕送风子系统和负压集气排风子系统；高压气幕送风子系统可设于座舱天花板中，包括高压气幕送风管路、高压气幕供气口以及增压风机；高压气幕送风管路一侧连接于交通工具空气分配系统的主送风管路，高压气幕供气口设于高压气幕送风管路的另一侧，所送出的气流形成自上而下的气幕以形成一隔离区；负压集气排风子系统可设于座舱地板下方，包括负压集气箱、排风管路、排风口、排气门，排风管路一侧连接于负压集气箱，另一侧连接于排气门；排风口设于负压集气箱的顶部；负压集气箱设于气幕隔离区对应的区域上。藉由该系统，可形成气幕隔离区以降低传染风险，且可与原有通风系统连接，实现在平疫不同情况下的转换。