本发明公开了新建防洪墙与已建防洪墙的连接结构及施工方法，包括已建防洪墙靠近与新建防洪墙连接的一端设有的延伸段；延伸段与新建防洪墙之间设有变形缝和埋入式止水装置；变形缝内填充有弹性材料形成封口；延伸段内和新建防洪墙内均根据变形缝对称的设有多层呈“凹”字形的已建防洪墙延伸段植筋和新建防洪墙配筋；每一已建防洪墙延伸段植筋和每一新建防洪墙配筋呈“凹”字形的内凹均围绕在埋入式止水装置相应部分的外侧。施工时，先在已建防洪墙植入已建防洪墙延伸段植筋、绑扎钢筋笼并埋入埋入式止水装置，完成延伸段的浇筑后，再设置新建防洪墙配筋并建造新建防洪墙，最后设置封口。本发明止水效果好、适应变形能力强、结构安全更有保障。