本发明提供一种预聚树脂的制备方法及涂料组合物，涉及涂料技术领域。本发明的预聚树脂的制备方法，包括以下步骤，甲基三甲氧基硅烷和正硅酸烷基酯按摩尔比0‑1:1‑10进行水解缩合，获得第一湿凝胶；获得的第一湿凝胶进行老化，获得第二湿凝胶；获得的第二湿凝胶用丙酮进行置换，再置入含有三甲基氯硅烷和含氨基二甲基氯硅烷的修饰液中进行修饰，获得第三湿凝胶；获得的第三湿凝胶用非质子极性有机溶剂进行置换，再加入异氰酸酯化合物，反应2‑72小时，除去所述极性有机溶剂，获得所述预聚树脂。本发明的聚脲涂料组合物包含上述预聚树脂，固化后的聚脲涂层具有耐高低温、耐冷热循环冲击、附着力好等性能。