本发明涉及一种电网谐波相位分析方法、系统和装置。所述方法包括：获取关注母线的电压波形信号和电力用户馈线上的电流波形信号；将统计时间划分为多个计算窗口；且在每个计算窗口内，对所述电压波形信号和电流波形信号截取预设数量个周波；对所述预设数量个周波进行快速傅里叶变换，得到每相电压信号的谐波相量和每相电流信号的谐波相量；根据所述每相电压信号的谐波相量获取每相基波电压上升沿的过零点时刻，并根据所述每相电流信号的谐波相量获取每相电流信号各次谐波在各相所述过零点时刻的相位；基于在统计时间内获得的所有相位数据进行分析。上述电网谐波相位分析方法、系统和装置能够更准确地反映谐波电流相位分布，且兼具有相序容错能力。