本发明涉及一种微流控芯片的吸收光度检测系统，在微流控芯片内设置有z型样品通道和两个遮光通道；两个遮光通道均设置有通光口；第一光纤准直器依次通过通光口、所述第二样品管路和通光口后与第二光纤准直器对应设置；激光光源产生激光；第一光纤准直器对激光进行准直，并将准直后的光束通过通光口照射在第二样品管路内的待检测样品上；第二光纤准直器接收经过待检测样品后的透射光；光电二极管将透射光转换为电信号；上位机根据电信号确定并显示吸收光度。本发明还在微流控芯片上集成两个遮光通道形成光学狭缝，避免接收到杂散光，从而影响检测吸收光度的准确性。