本发明公开了一种汽车发电机的控制系统，它的电量传感器用于采集蓄电池的工况信息，并将蓄电池的工况信息发送给发动机控制模块；发动机控制模块用于利用蓄电池的工况信息判断蓄电池的电量是否处于饱满状态；当蓄电池的电量不处于饱满状态时，发动机控制模块向发电机发送发电机控制信号，发电机依据发电机控制信号结合发电机控制程序输出对应的供电电压和电流使蓄电池充电到电量饱满状态，发电机控制信号的信号值与发电机的供电电压和电流对应成矩阵关系,该矩阵关系设置在发电机控制程序中；发电机在预设时间内没有收到发电机控制信号或发电机控制信号接线断开，发电机进入默认控制程序。本发明能控制稳定，能降低发动机油耗，方便用户检测。