本发明公开了一种用于大型水库滤食性鱼类的放牧式养殖方法，涉及水产养殖技术，解决了目前的大面积水域滤食性鱼类养殖方式不能同时兼顾优化水质和养殖经济效益的技术问题。构建一可移动至水域范围内任一位置的养殖渔场，并在所述养殖渔场中设置容积可变的养殖区以及用于捕获养殖区中滤食性鱼种的捕捞区；将滤食性鱼种投放至养殖区中，根据所述水域中营养物质的分布移动养殖渔场，以使滤食性鱼种可摄食营养物质充足区域中的营养物质。本发明还公开了一种用于大型水库滤食性鱼类的放牧式养殖系统。本发明鱼种放养成活率高、起捕方便、除藻效果好、净水效果好，既能达到优化大面积水域水质的作用，也提高了养殖的产量，取得更好的经济效益。