本发明涉及确定细胞捕获的技术领域，更具体地说，本发明涉及一种细胞捕获系统、捕获的控制方法和相关设备，其中，所述细胞捕获系统包括：器皿组件，所述器皿组件放置有细胞捕获所需的试剂；多通路阀门，所述器皿组件连接于所述多通路阀门；公共液路端口，连接于所述多通路阀门，所述公共液路端口用于滞留所述器皿组件中的所述试剂；细胞捕获芯片，连接于所述多通路阀门。通过将器皿组件的试剂输送至公共液路端口中缓存，以去除器皿组件和多通路阀门之间的气泡，如此设置排除了气泡对细胞捕获的干扰，使得细胞捕获芯片分离出的循环肿瘤细胞的数量准确，能够精准的判断病人当前的病情，为针对性治疗提供准确的参考。