基于NanoString平台用于检测肺癌基因融合的方法
实质审查的生效
摘要
本发明公开了一种基于NanoString平台用于检测肺癌基因融合的检测方法,该方法包括:1、基因融合信息收集和管家基因确定;2、探针设计;3、建立阳性阈值计算模型和阳性结果判定;它收集了目前肺癌靶向治疗相关的大部分融合类型,并确定了每个基因融合断点处的上下游序列,以及基于element方法设计探针。与其他基于NanoString平台检测的肺癌相关融合更加全面,尤其是在MET和NTRK1/2/3这四个基因的融合方面;通过检测ROS1基因5’和3’端是否不平衡的方式检测是否发生融合一直是一个难题,检测灵敏度很低且阈值很难判定,我们重新优化了算法并确定了新的阳性判断标准。
基本信息
专利标题 :
基于NanoString平台用于检测肺癌基因融合的方法
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114410791A
申请号 :
CN202210104808.9
公开(公告)日 :
2022-04-29
申请日 :
2022-01-22
授权号 :
暂无
授权日 :
暂无
发明人 :
孙瑞王志中马杰赵九洲郭永军冯君楠
申请人 :
河南省肿瘤医院
申请人地址 :
河南省郑州市金水区东明路127号
代理机构 :
代理人 :
优先权 :
CN202210104808.9
主分类号 :
C12Q1/6886
IPC分类号 :
C12Q1/6886 C12N15/11 G16B25/20 G16B40/00
IPC结构图谱
C
C部——化学;冶金
C12
生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法;其所用的组合物或试纸;这种组合物的制备方法;在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验,如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6876
用于核酸分析的核酸产品,如引物或探针
C12Q1/6883
用于由遗传物质改变而引起的疾病
C12Q1/6886
用于癌症
法律状态
2022-05-20 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6886
申请日 : 20220122
申请日 : 20220122
2022-04-29 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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