本发明涉及体外诊断检测技术领域，具体涉及一种眼肿瘤融合基因的检测模型及构建方法和检测方法，通过从组织或血液中提取总RNA，将提取的总RNA用磁珠富集真核生物mRNA或用试剂盒去除原核生物的rRNA，以mRNA为模板，用六碱基随机引物合成第一条cDNA链，然后加入缓冲液、dNTPs、RNase H和DNA polymerase I合成第二条cDNA链，构建DNA文库，将DNA文库用进行靶向捕获，得到靶向捕获文库并进行质检，得测序文库，进行测序；将原始测序序列去除接头和低质量碱基；将处理后的原始测序序列进行分析，并与原始测序序列相应的参考基因组信息进行对比；本发明可解决现有技术中对眼肿瘤融合基因检测操作复杂、成本高和样本投入大的问题，并为选择准确有效的眼部肿瘤治疗靶位奠定基础。