本申请公开了一种基于深度学习的皮蛋裂纹检测分选系统和方法，本系统包括输送台、拍照单元、测速单元、控制单元、图像处理单元和分选单元。输送台带动皮蛋向拍照单元移动。拍照单元对皮蛋进行图像采集。图像处理单元根据图像进行裂纹识别。测速单元监测输送台的输送速度；控制单元根据输送速度，控制图像处理单元获取图像，以及根据皮蛋的裂纹识别结果，控制分选单元分选出带有裂纹的皮蛋。本方法包括：对皮蛋的不同面进行图像采集；图像拼接；训练深度学习模型中，得到皮蛋裂纹识别模型。将皮蛋图像放入皮蛋裂纹识别模型中进行裂纹判断；对判定为裂纹皮蛋的皮蛋进行分选。本申请具有准确率高、检测速度快、检测性能稳定、实用价值高等优势。