本发明公开了基于松散的数据包络分析模型的海水入侵评价预测方法，包括如下步骤：构建考虑非期望产出的基于松散的数据包络分析模型；根据海水入侵区的范围及研究目标确定构建评价预测模型的区域尺度；根据区域尺度，确定区域海水入侵的预测评价指标并调查获取相应预测评价指标的代表值；将预测评价指标的代表值代入到数据包络分析模型中，计算得出特定时间段内的区域环境绩效水平；对比环境绩效水平与海水入侵距离L，并根据两者的变化趋势进行海水入侵未来发展趋势的评估预测。本发明考虑了多重影响因素的共同作用和海水入侵的影响特征，能够更加准确地预测区域海水入侵未来发展趋势。