确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针...
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摘要
本发明公开一种确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组。该方法为使用肿瘤单个样本且基于二代测序技术的方法,其包括以下步骤:(1)初步筛选得到由多个微卫星位点组成的候选位点集;和(2)计算候选位点集中各微卫星位点对于MSI状态的贡献度,并根据贡献度大小对候选位点集中的微卫星位点进行排序,取排名前n的微卫星位点组成筛选位点集,利用筛选位点集计算MSI‑H和MSS两组样本的样本MSI评分,根据样本评分得到所需的位点组合。本发明的位点组合不仅能够提高微卫星状态检测的准确度和灵敏度,同时大大降低单样本流程的检测成本。
基本信息
专利标题 :
确定用于检测微卫星不稳定状态的位点组合的方法、系统及探针组
专利标题(英):
暂无
公开(公告)号 :
CN114150067A
申请号 :
CN202210115294.7
公开(公告)日 :
2022-03-08
申请日 :
2022-02-07
授权号 :
CN114150067B
授权日 :
2022-05-17
发明人 :
杨洲张吉娜刘金洋张美俊孙雪王伟伟田埂
申请人 :
元码基因科技(北京)股份有限公司
申请人地址 :
北京市朝阳区广顺北大街5号融创动力产业园A栋4层
代理机构 :
北京北汇律师事务所
代理人 :
李英杰
优先权 :
CN202210115294.7
主分类号 :
C12Q1/6886
IPC分类号 :
C12Q1/6886 C12Q1/6869
IPC结构图谱
C
C部——化学;冶金
C12
生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
C12Q
包含酶、核酸或微生物的测定或检验方法;其所用的组合物或试纸;这种组合物的制备方法;在微生物学方法或酶学方法中的条件反应控制
C12Q1/64
•地质微生物试验,如用于石油
C12Q1/68
包括核酸
C12Q1/6876
用于核酸分析的核酸产品,如引物或探针
C12Q1/6883
用于由遗传物质改变而引起的疾病
C12Q1/6886
用于癌症
法律状态
2022-05-17 :
授权
2022-03-25 :
实质审查的生效
IPC(主分类) : C12Q 1/6886
申请日 : 20220207
申请日 : 20220207
2022-03-08 :
公开
注:本法律状态信息仅供参考,即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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