本发明提供了一种同轴度检测方法及系统，涉及同轴度检测领域。所述方法：首先，旋转轴装置响应控制装置发送的启动指令，以预设速率旋转待检测工件；然后，图像采集装置响应控制装置发送的图像采集指令，按照预设周期采集多张待检测工件的端面的图像，并将多张图像上传给控制装置；接着，控制装置提取每一所述图像中的端面的中心点位置信息；最后，控制装置根据所有图像中的端面的中心点位置信息，得到待检测工件与旋转轴装置的同轴度。本发明的方法避免了在检测过程中破环工件表面涂层，以及粗糙的工件表面对检测结果的准确性的影响，同时提高了检测效率并且不受工件尺寸的限制。