本发明公开了一种大叶蛋白菊酵素饲料的制备方法，包括：S1、将大叶蛋白菊清洗打浆破碎过滤，得浆汁；S2、将浆汁进行酶解，得酶解液；S3、将酶解液过滤得滤液，在滤液中加入蔗糖，杀菌，得待发酵滤液；S4、向待发酵滤液中加入混合益生菌发酵，得酵素液；S5、以酵素液为芯材，以β‑环糊精溶液为第一包埋壁对芯材进行包埋，得第一包埋液，以海藻酸钠溶液为第二包埋壁对第一包埋液进行包埋，得第二包埋液，以壳聚糖溶液为第三包埋壁对第二包埋液进行包埋，得第三包埋液，包埋后冷冻干燥，得酵素粉；S6、将酵素粉加入饲料中混匀，得酵素饲料；本发明能够减缓酵素释放的速度，提高酵素的利用率，从而提高了饲料的转化率和利用率。