本发明提供了一种高抗菌聚丙烯材料及其制备方法和应用，涉及通用塑料技术领域。本发明提供的聚丙烯材料，包括如下重量份数的组分：等规度大于90%的聚丙烯70‑85份、低等规聚丙烯5‑30份、复合抗菌剂1‑2份和加工助剂2‑5份，其中，所述复合抗菌剂为苯基甘氨酸、壳聚糖和乙二胺四乙酸的复配物。本发明通过将苯基甘氨酸、壳聚糖和乙二胺四乙酸三者复配后作为复合抗菌剂，并在原料中引入一定比例的低等规聚丙烯，制备的聚丙烯材料对白色念珠菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、金黄色葡萄球菌具有良好的抑菌性能，抑菌率可达99%以上。本申请中未采用金属抗菌剂，制备的聚丙烯材料中重金属含量低于行业最低标准，极大地提升了聚丙烯材料的应用安全性。