本发明公开了一种纸质文件电子化存储方法、装置和系统，方法包括：根据文件类别生成对应的登记表文件；在纸质文件上设置记载有纸质文件所对应的文件类别的二维码标记；将纸质文件进行标准化影像提取，得到第一图片；从第一图片中扫描二维码标记得到二维码标记所记载的文件类别；根据文件类别，调取对应的裁剪程序，以对第一图片进行针对性留白裁剪得到第二图片；将第二图片存储在存储器中，得到第二图片的存储路径；根据文件类别，将存储路径写入到文件类别所对应的登记表文件中。还提供了执行纸质文件电子化存储方法的装置和系统。实现了对电子化后的纸质文件的合理分类，便于后期的读取和调用。本发明主要用于数据处理技术领域。