本发明特别涉及一种云文件存储细粒度QoS控制方法及系统。该云文件存储细粒度QoS控制方法及系统，在Samba配置文件导出后端存储的部分中读吞吐量最大值、写吞吐量最大值、读IOPS最大值和写IOPS最大值四个配置项；在Samba服务器启动时将配置项读到内存中，后续操作不再与磁盘交互；在Samba中增加令牌池模块、限速模块及API模块，以读取配置文件中每个SMB文件系统的QoS设置，并保存在内存的令牌池中，分别限制每个SMB文件系统每秒钟处理的数据包总大小和IO数量。该云文件存储细粒度QoS控制方法及系统，能够针对各SMB文件系统分别设置吞吐量及IOPS，防止单个SMB文件系统占用过多资源，影响其他SMB文件系统性能，从而实现了资源的按需分配，使每个文件系统都能合理的占用资源。