本发明提供了一种消化内科用于胃癌检测的取样系统，其包括：图像采集模块，用于基于预设胃镜获取目标检查者的胃镜图像，并基于所述胃镜图像确定病灶位置；标记模块，用于基于所述病灶位置在所述胃镜图像进行标记，并基于标记结果控制预设装置采集所述病灶位置的目标生物样本集；取样模块，用于确定所述目标生物样本集中各目标生物样本活性，并基于所述目标生物样本活性对目标生物样本集进行筛选，得到目标胃癌检测样本。通过观察患者胃内部的病变情况，并根据病变情况对病变位置进行准确有效的生物样本采集，确保为胃癌检测提供可靠的生物样本，提高了对生物样本取样的有效性以及准确率。