一种基于大数据的基因分析方法及系统
实质审查的生效
摘要
本发明提供了一种基于大数据的基因分析方法及系统，在将基因分析任务提交到大数据平台Hadoop的Yarn后，根据计算节点上各个Map任务对应的基因组数据的切片大小及数量计算所述计算节点上Map任务对应的数据量，获取计算节点的空闲内存大小以及CPU占用率，根据所述Map任务对应的数据量、所述空闲内存大小以及所述CPU占用率，确定Kvbuffer大小；在达到Spill的触发条件后，确定Kvbuffer新的分界点equator，并根据Spill触发频率重新确定Spill的阈值，Spill线程将Kvbuffer中的数据输出到磁盘，当Map阶段结束后，运行Reduce阶段，输出基因分析结果。本发明避免了频繁在内存和磁盘间复制数据导致基因分析时间过程的问题，有效降低了基因分析的用时。
基本信息
专利标题 ：
一种基于大数据的基因分析方法及系统
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114550833A
申请号 ：
CN202210137231.1
公开（公告）日 ：
2022-05-27
申请日 ：
2022-02-15
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
马骞宋晓琴白睿敏伍东红高金玲谷倬宇车凌仪陈义兵
申请人 ：
郑州大学
申请人地址 ：
河南省郑州市高新技术开发区科学大道100号
代理机构 ：
郑州意创知识产权代理事务所(特殊普通合伙)
代理人 ：
张江森
优先权 ：
CN202210137231.1
主分类号 ：
G16B45/00
IPC分类号 ：
G16B45/00
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B45/00
特别适用于与生物信息学相关的数据可视化，例如地图或网络展示的ICT
法律状态
2022-06-14 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 45/00
申请日 : 20220215
申请日 : 20220215
2022-05-27 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
文件下载
暂无PDF文件可下载
