本申请涉及一种基于深度学习的多阶段多层次骨赘检测方法，通过获取骨赘的Dr图像；根据所述Dr图像，分别提取股骨和胫骨的掩码，并对股骨和胫骨进行分割；基于所述股骨和胫骨的掩码，设定骨赘检测目标，并采用预设深度学习模型对所述骨赘检测目标进行多层次检测，获得骨赘区域；预设提取条件，从所述骨赘区域中提取得到骨赘点。能够对股骨和胫骨进行分割，提取到股骨和胫骨的连接附近的ROI区域，将骨赘检测聚焦在此区域中，同时提高骨赘点的检测准确性。在多层次骨赘检测模块中，建立父子矩形框，逐步降低父矩形框的损失函数的权重，逐步提高模型对骨赘点子目标的关注度的同时提高训练效率。