本发明涉及制药领域，具体而言，涉及一种含有花青素的组合物及其制备方法和应用。所述的含有花青素的组合物，主要成分包括花青素和复合菌粉；所述花青素的含量为55～65mg/g；所述复合菌粉的有效活菌数为10⁷～10¹⁰CFU/g；其中，所述复合菌粉包括第一复合菌粉和/或第二复合菌粉；所述第一复合菌粉包括罗伊氏乳杆菌、发酵乳杆菌、瑞士乳杆菌或鼠李糖乳杆菌中的一种或几种的组合；所述第二复合菌粉包括乳双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、副干酪乳杆菌或植物乳杆菌中的一种或几种的组合。所述的含有花青素的组合物，具有预防和延缓视网膜黄斑变性发生发展的功效。