本发明公开了一种水轮机主轴密封装置，包括套设于主轴上的护套环、依次套设于所述护套环上的一级密封泵轮、二级密封泵轮、停机密封环，所述护套环、一级密封泵轮、二级密封泵轮、停机密封环随主轴同时转动，所述密封装置还包括依次叠装于顶盖上的一级密封座、二级密封座、密封盖。本发明通过一级密封座、一级密封泵轮与护套环和二级密封座、二级密封泵轮与护套环的配合形成了漏入区，漏入区内的水压在离心力的作用下形成靠近圆周处的高压、靠近中心处低压，放置了水从圆周处漏出，形成多次离心密封。使得水轮机无漏水，实现了不接触、无摩擦密封，延长了密封装置的使用寿命，降低了维护成本，运行稳定、安全、可靠。