本发明涉及肥料取样技术领域，尤其是涉及一种肥料自动取样器。包括安装在肥料传送带上方的支撑架，所述支撑架上设有转盘，所述转盘上设有若干个取样瓶，所述转盘底部与电机连接，所述转盘一侧设有可随肥料传送带转动的转轴，所述转轴上设有取样勺。本发明提供的肥料自动取样器，通过设置随肥料传送带转动的转轴带动取样勺转动，取样勺随皮带运动将带出的肥料直接抛入取样瓶中，从而实现实时取样的目的；通过设置的电机带动转盘转动实现每间隔一定的时间更换取样瓶的目的。该取样器减少了取样人员的工作强度，提高了工作效率，取出的样品更具有代表性，不会出现漏检问题。