本发明提供一种多工位刀具专用磨床控制方法、系统和存储介质，所述方法包括：根据目标刀具的形状将刀具加工过程分成多个依序的工位；基于每个工位的加工工艺选定适配种类的加工机构；获取每种加工机构完成对应工位的单件加工时间；按照各个加工机构的单件加工时间的比例关系配置每种加工机构的数量，并将配置好数量的每种加工机构固定在磨床的底座上；启动磨床加工，上一个工位的某个加工机构完成对刀具A的加工后，则放入上一个工位的完成收纳槽中，以待下一个工位的某个加工机构空闲时，自动从上一个工位的完成收纳槽中取出刀具A，并进行下一个工位加工。本发明能够提升刀具的生产效率，并确保成品刀具的合格率。