一种强化型浮动生物生态系统及其在受污染水体修复中的应用，属于受污染水体修复技术领域。本发明强化型浮动生物生态系统包括生物生态模块、电子受体模块、电子供体模块、电子传导模块和外电路模块；所述电子受体模块通过连接装置固定在生物生态模块上，所述电子供体模块固定于受污染水体下的沉积物中并通过电子传导模块与外电路模块的一端连接，所述外电路模块固定在生物生态模块上，所述外电路模块的另一端与电子受体模块连接。本发明构建了模块化、组装方便的强化型浮动生态系统，实现对受污染天然水体和沉积物的同步强化治理，具有效率高、构型灵活、能量回收且易施工维护的优点。