本发明公开了基于频域特征的水电机组状态监测波形信号数字滤波方法，具体涉及信号数字滤波技术领域，包括步骤一、获取波形采样参数；步骤二、获取该通道原始时域波形数据；步骤三、获取波形滤波参数；步骤四、进行快速傅里叶变换计算以及对原始时域波形数据和波形全部FFT频域特征数据进行关联存储；步骤五、滤除指定频段的谱线；步骤六、根据该频域特征数据进行快速傅里叶逆变换计算；步骤七、还原该通道时域波形数据以及对数字滤波后的波形FFT频域数据和滤波后的时域波形数据进行关联存储；步骤八、判断是否完成所有信号无效频段的滤除；步骤九、获取通道滤波后时域波形数据。本发明提高了机组检测和维护的效率。