本发明提供一种基于小角中子散射表征页岩孔隙结构各向异性的方法，包括：制备待测页岩样品；对样品进行小角中子散射实验，获得椭球形各向异性二维散射剖面；对二维散射剖面划分积分区域，对各个方位角上的散射强度进行计算，并绘制散射强度相对于方位角的非均匀分布图；选择最大和最小散射强度区，获取对应的一维散射曲线；对一维散射曲线进行校正以及拟合处理，获取样品的孔隙结构信息；通过对比两个不同方向上的孔隙结构信息，表征孔隙结构的各向异性。本发明提供了一种全新的表征页岩孔隙结构各向异性的方法，基于小角中子散射实验定量表征孔隙结构的各向异性，为探寻油气运移优势通道提供了有效手段，对油藏精细评价和有效开采有重要意义。