本发明公开的多卫星在变轨条件下的一种轨道计算实时仿真系统及仿真方法，包括：轨道计算子系统，所述轨道计算子系统用于计算卫星的轨道根数；根据变轨参数选择恰当的变轨方式，与其它子系统进行互操作，实时接收控制指令和仿真信息，响应用户推演过程中输入的轨道命令并进行轨道转移，实时为其它模块输出卫星位置信息；可视化表现子系统，所述可视化表现子系统整个仿真过程二维态势、三维态势可视化表现和感兴趣参数的曲线绘制；网络通信子系统，所述网络通信子系统负责根据HLA接口规范将整个系统作为仿真联邦成员加入到仿真联邦中；本发明辅助多卫星在变轨条件下的一种轨道计算实时仿真，解决多卫星变轨条件下缺乏有效轨道计算实时仿真系统问题。