本发明涉及一种有机复合污染土壤的强化微生物修复系统，包括若干个反应器、供液模块、供气模块和控制装置，反应器的上部设有喷淋喷头，用于喷淋含有多环芳烃降解菌液，中部填充待修复土壤，底部设有进气口和菌液回收口，进气口用于通入空气，菌液回收口用于回收菌液并再次回流；供液模块包括若干个第一液泵和若干个液体流量计，每个第一液泵通过供液管道分别连接对应的反应器的喷头，每个供液管道上设置一个液体流量计；供气模块包括第一气泵和若干个气阀，第一气泵通过并联的供气管道分别连接反应器的进气口，每个供气管道上设置一个气阀。