本发明公开了一种利用微波加工鲜食玉米的装置及方法，包括微波设备和无菌室，微波设备内贯穿安装有水平的杀菌管道，杀菌管道的两端均伸出微波设备外部，且其一端伸入无菌室内部；所述杀菌管道内设有用于传输玉米的前端传送带；所述微波设备的一侧设置有用于放置塑料包材的包材支架使得塑料包材包裹着杀菌管道的外壁并能够与玉米同向等速地沿着杀菌管道移动；所述无菌室内安装有包材封装结构和紫外灯。本发明装置及方法能够防止玉米在杀菌过程中水分过分蒸发，使得产品口感鲜嫩。