本发明公开了一种心磁介入式探头和心磁测量系统，所述心磁介入式探头包括：探头本体、导管、微波波导和辐射结构，导管与探头本体连接，微波波导嵌设于导管内且沿导管的长度方向延伸，微波波导的一端与微波系统连接，辐射结构设于探头本体内，用于将微波波导传输的微波向四周发射。根据本发明的心磁介入式探头，通过将导管与探头本体连接，将微波波导嵌设于导管内并沿导管的长度方向延伸，微波导管的一端与微波系统连接，将辐射结构设在探头本体内，通过辐射结构使微波波导传输的微波向四周扩散，使心磁介入式探头进入人体血管后可以发射微波，同时也使心磁介入式探头省去了线圈，从而可以缩小介入式探头的体积，可以提高心磁测量系统的测量范围。