本发明涉及分离厌氧发酵的技术领域，且公开了一种分离式两相厌氧发酵发酵装置，包括进给机构，所述进给机构包括密封盖，所述密封盖的顶部卡接有进料漏口，所述进料漏口的底部转动连接有封闭板。该分离式两相厌氧发酵发酵装置，通过主动轴带动切换轴旋转，切换轴带动分流齿轮和输出齿轮旋转，分流齿轮通过环形齿轮带动分料板旋转，分料板带动调节刀片旋转，输出齿轮带动输出螺杆旋转，同时加压轮组带动加压活塞旋转，加压活塞带动分流板分流酸液，再通过进料漏口和封闭板等机构的配合使用，分流发酵固体，使固体发酵物可均匀进行气体发酵，均匀喷淋可使气体均匀输出，固体物质可进行均匀输出的效果。