本发明属于生物质催化转化领域，具体涉及一种以D‑乙酰氨基葡萄糖转化制色原体三的方法。该方法以甲壳素类生物质单体D‑乙酰氨基葡萄糖为原料，低共熔溶剂作为催化剂，N,N‑二甲基乙酰胺为反应溶剂，在一定温度下加热反应，D‑乙酰氨基葡萄糖经开环，闭环，脱去两分子水反应生成含有色原体三粗产品的混合液。将粗产品混合液过滤去除不溶杂质，然后萃取、减压蒸馏，得到产品色原体三。该方法克服了现有制备色原体三反应中存在的反应过程繁琐、反应条件严苛、反应选择性差、产率低等问题。本发明具有工艺简单、成本低、过程无污染、所得产品纯度高等优点。