本申请公开了一种利用太阳光活化高碘酸盐灭活水体中细菌的方法，涉及水体细菌灭活技术领域，该方法通过将高碘酸盐溶解于待处理的含细菌水体中形成混合体系，将所述混合体系于太阳光光照条件下反应，以实现细菌灭活。可见，利用太阳光可以激发高碘酸盐产生强氧化性自由基，攻击细胞膜从而灭活水体中的细菌，本申请能够应用于自来水、河水和海水等天然水体中，实现水体净化的目的，且无需引入激发剂，节约能源的同时降低二次污染。