本发明公开了一种羟氯喹侧链精制方法，将有机酸和醇类溶剂搅拌溶解混匀后，加入到羟氯喹侧链粗品中，搅拌并降温析晶，过滤出的滤饼用少量醇类溶剂洗涤，然后减压烘干得到固体；取烘干的固体，加入碱和无水乙醇，升温并搅拌，之后降温析晶，过滤出的滤饼用无水乙醇洗涤，而滤液在65℃减压浓缩至无馏分，得到的浓缩液进行减压蒸馏，收集馏分，得到无色液体，即得到GC纯度99％以上的羟氯喹侧链精品。本方法将羟氯喹侧链粗品从精馏纯化改进为通过成盐结晶，除掉了绝大部分的杂质，后续通过简单蒸馏即能得到高纯度成品，降低了精馏能耗、节省了因反复套蒸导致增加的工时、降低减压蒸馏的难度、对设备要求也进一步降低，具有普适性。