本发明公开了一种应用于多尺度电磁波问题分析的高效数值仿真方法，包括：步骤1，根据多尺度电磁波问题的几何结构，采用局部亚网格剖分技术对计算区域进行空间网格剖分；步骤2，采用FDTD方法对粗网格区域的电磁场量进行求解；步骤3，采用PITD方法对细网格区域的电磁场量进行求解；步骤4，粗网格区域与细网格区域分界面上电磁场量的计算；步骤5，重复上述步骤，完成所有迭代步数。本发明专利在两种算法的分界面上采用了嵌套网格技术，构建了一种稳定的信息交互策略，使得本专利所建立的混合算法在进行长时间迭代后，仍然能够稳定运行，具有很好的长时稳定性。